中文Nova varietat de coronavirus 501Y-V2 de Sud-àfrica
El 18 de desembre de 2020, Sud-àfrica va detectar un mutant 501Y-V2 del nou coronavirus.Ara el mutant sud-africà s'ha estès a més de 20 països.Els experiments han demostrat que, per sobre dels nous mutants del virus de la corona, poden portar altres variants del nou coronavirus de mutacions K417N/T, E484K i N501Y que poden reduir la capacitat neutralitzadora dels anticossos neutralitzadors de plasma induïts per la vacuna.Tanmateix, en comparació amb el genoma de referència Wuh01 (número de seqüència MN908947), la seqüència del genoma mutant 501Y.V2 de Sud-àfrica té 23 variants de nucleòtids.Té la mateixa mutació N501Y que el subtipus B.1.1.7 del mutant Gran Bretanya, però encara conté mutacions en dos llocs clau E484K i K417N de la proteïna S que tenen efectes potencialment importants sobre la capacitat d'infectar del virus.
El nou coronavirus és un virus d'ARN monocatenari, les mutacions del genoma són més freqüents.La detecció d'un sol objectiu pot conduir fàcilment a la detecció perduda de mostres amb baixa càrrega viral i soques de virus mutats.La taxa de reexamen en l'únic positiu en la detecció diana, pot arribar a més del 10%, la qual cosa pot augmentar la càrrega de treball i allargar el temps de diagnòstic.La detecció multi-objectiu i la verificació mútua dels resultats de cada objectiu pot augmentar la taxa de detecció i facilitar el diagnòstic precoç.
Figura 1. Diagrama esquemàtic del mecanisme d'infecció per Nou Coronavirus
Nou Coronavirus Mutant B.1.1.7 de Gran Bretanya
El 26 de desembre de 2020 es va publicar en línia el primer article científic de la soca B.1.1.7.L'Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, va confirmar que la soca B.1.1.7 és més capaç de propagar-se que altres soques, que va ser més del 56% (IC del 95% 50-74%).Com que aquesta nova soca mutant té un poder de transmissió més evident, s'ha tornat més difícil controlar la COVID-19.L'endemà, la Universitat de Birmingham al Regne Unit va penjar un article sobre MedRxiv.L'estudi va trobar que el nombre de còpies del gen del virus ORF1ab i N en pacients infectats amb la soca mutant B.1.1.7 (abandonament del gen S) va augmentar significativament;aquest fenomen es va controlar a la població.Aquest article assenyala que els pacients infectats amb el mutant B.1.1.7 de Gran Bretanya tenen una càrrega viral significativament més alta, per la qual cosa aquest mutant també pot ser més patògen.
Figura 2. La seqüència de mutació del genoma continguda a la soca mutant de coronavirus B.1.1.7 de Gran Bretanya
Figura 3. La mutació N501Y es va produir tant a Gran Bretanya com a Sud-àfricaVariants
Kit de detecció de noves variants de coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. ha desenvolupat amb èxit un kit de detecció per a noves variants de coronavirus B.1.1.7 i 501Y-V2.
Avantatges d'aquest producte: alta sensibilitat, detecció simultània de 4 dianes, que cobreix els principals llocs de mutació de la soca mutant B.1.1.7 i la soca mutant sud-africana 501Y.V2.Aquest kit pot detectar simultàniament els llocs de mutació N501Y, HV69-70del, E484K i el nou gen del coronavirus S;Prova ràpida: només triga 1 hora i 30 minuts des de la recollida de la mostra fins al resultat.
Figura 4. Detecció de la corba d'amplificació de la variant britànica COVID-19
Figura 5. Detecció de la corba d'amplificació de la variant sud-africana de COVID-19
Figura 6. Corba d'amplificació del nou coronavirus tipus salvatge
No està clar com aquestes mutacions acumulen un nou impacte a llarg termini de la pandèmia COVID-19.Però això ens recorda que aquestes mutacions poden afectar l'efectivitat de la immunitat natural i la immunitat provocada per la vacunació.També ens recorda que hem de fer un seguiment continuat del nou coronavirus durant molt de temps i actualitzar la vacuna contra la COVID-19 per fer front a l'evolució del nou coronavirus.
Hora de publicació: 12-mar-2021